Zakynthos kun je bereiken per chartervlucht vanuit Nederland in de zomermaanden. De vlucht duurt ongeveer 2 uur en 45 minuten. De luchthaven (Dionysios Solomos) heeft een landingsbaan en het vliegveld wordt door de International Air Transport Association (IATA) aangeduid met luchthavencode ZTH. Je kunt verder doorvliegen naar Athene.

Vanuit de haven van Zakynthos-stad gaat regelmatig een boot naar Kylini op de Peloponnesos op het vasteland van Griekenland en naar de havenplaats Brindisi in Italië. In Agios Nikolaos (in het noorden) is een bootverbinding met het eiland Kefalonia.